理论与实践的关系问题首先表现在不同性质的院校对理论和实践的要求不一致，导致理论与实践失衡。课程设置中理论与实践的合理分配是学前教育学学科研究的一个重要方面，对于学前教育人才的培养具有现实意义。幼儿师范学校的课程设置偏重实践，重视学生教育教学技能的培养，相对地轻视学生基础理论的学习。而在高校学前教育专业的课程设置中，情况则与之相反，学生的学习主要为基础理论学习，采用传统的课堂模式，学科见习和实习时间相对不足。这便造成了幼儿师范学校“重实践、轻理论”和高等院校学前教育专业“重理论、轻实践”的现象，导致了学前教育学学科理论与实践应用失衡的局面。理论与实践的失衡，一方面使高校的理论研究无法及时广泛传播到学前教育一线，导致学前教育实践的时代性、科学性不足；另一方面使高校无法及时了解学前教育实践情况，造成理论研究的应用性不足，对教育实践的指导意义不明显。这样一来，学前教育学理论与实践割裂的局面则更严重。
对此，许多研究者提出要平衡各类院校中学前教育理论的学习与实践的开展，以促进实践与理论结合，密切二者间的关系。有的学者提出要培养有坚实理论知识基础和较高综合实践能力的、与时代特色相适应的应用型人才；有的提出要防止学前教育课程改革出现过度实践化的倾向；有的提到要重视学前教育学的理论价值，同时加强学前教育实践；有的呼吁学前教育人才培养进行实践转向，要重视学前教育的实践性。学前教育学既是一门基础理论学科，又是一门应用型学科，如何将理论与实践结合，让理论成为指导实践的依据，让实践成为理论发展的基础，这是该阶段学前教育学学科发展的重要问题之一。